Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zmiz1Q6P1E1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zmiz1Q6P1E1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zmiz1Q6P1E1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zmiz1Q6P1E1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zmiz1Q6P1E1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zmiz1Q6P1E1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms