Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slx4Q6P1D7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slx4Q6P1D7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Slx4Q6P1D7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms