Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pprc1Q6NZN1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pprc1Q6NZN1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pprc1Q6NZN1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms