Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpdc1Q6NZK8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms