Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fbxo41Q6NS60 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo41Q6NS60 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo41Q6NS60 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms