Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CltbQ6IRU5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CltbQ6IRU5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms