Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt40Q6IFX3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt40Q6IFX3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms