Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Arhgap20Q6IFT4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms