Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf8Q6DID3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf8Q6DID3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms