Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Smarca2Q6DIC0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Smarca2Q6DIC0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms