Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nop58Q6DFW4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nop58Q6DFW4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms