Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

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Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cep290Q6A078 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Cep290Q6A078 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
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Cep290Q6A078 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Cep290Q6A078 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Cep290Q6A078 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cep290Q6A078 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms