Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PatjQ63ZW7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PatjQ63ZW7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms