Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col4a5Q63ZW6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col4a5Q63ZW6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a5Q63ZW6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms