Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic3Q62521 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Zic3Q62521 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms