Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Supt6hQ62383 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Supt6hQ62383 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Supt6hQ62383 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms