Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf6Q62311 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms