Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sycp1Q62209 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sycp1Q62209 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms