Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
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Trim27Q62158 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Trim27Q62158 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Trim27Q62158 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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Trim27Q62158 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim27Q62158 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
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Trim27Q62158 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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Trim27Q62158 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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Trim27Q62158 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
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