Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Npm1Q61937 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Npm1Q61937 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms