Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usf1Q61069 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usf1Q61069 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usf1Q61069 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms