Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms