Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scarb1Q61009 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Scarb1Q61009 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarb1Q61009 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Scarb1Q61009 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms