Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik1Q60934 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms