Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot7Q60809 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot7Q60809 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms