Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf3Q60765 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf3Q60765 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf3Q60765 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms