Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PmelQ60696 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PmelQ60696 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PmelQ60696 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms