Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm1Q60636 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm1Q60636 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm1Q60636 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm1Q60636 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms