Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nr2f1Q60632 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr2f1Q60632 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms