Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brip1Q5SXJ3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brip1Q5SXJ3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms