Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psme4Q5SSW2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psme4Q5SSW2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms