Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Bhlha9Q5RJB0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms