Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rapgef6Q5NCJ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rapgef6Q5NCJ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rapgef6Q5NCJ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms