Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ttf2Q5NC05 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ttf2Q5NC05 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms