Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lrig2Q52KR2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms