Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C2cd3Q52KB6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2cd3Q52KB6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms