Protein–RNA interactions for Protein: Q505G8

Znf827, Zinc finger protein 827, mousemouse

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf827Q505G8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
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Znf827Q505G8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf827Q505G8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Znf827Q505G8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Znf827Q505G8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Znf827Q505G8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Znf827Q505G8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Znf827Q505G8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Znf827Q505G8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Znf827Q505G8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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