Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl6Q505G4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rtl6Q505G4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl6Q505G4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms