Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Shank3Q4ACU6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Shank3Q4ACU6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Shank3Q4ACU6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms