Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ulk4Q3V129 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ulk4Q3V129 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms