Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4930567H17RikQ3V0K5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms