Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Garnl3Q3V0G7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms