Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Obox3Q3UT54 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Obox3Q3UT54 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms