Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Rtl4Q3URY0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rtl4Q3URY0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Rtl4Q3URY0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rtl4Q3URY0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rtl4Q3URY0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rtl4Q3URY0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rtl4Q3URY0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtl4Q3URY0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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