Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp560Q3URI6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp560Q3URI6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms