Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Elf3Q3UPW2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Elf3Q3UPW2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms