Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b2Q3UJB0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms