Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf224Q3UIW8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf224Q3UIW8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms