Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Greb1Q3UHK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Greb1Q3UHK3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Greb1Q3UHK3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms