Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zswim8Q3UHH1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zswim8Q3UHH1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zswim8Q3UHH1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms